合作合同纠纷一般表现为合伙协议纠纷，合伙协议是依法由全体合伙人协商一致，以书面形式订立的合伙企业的契约。若因合作合同引起的纠纷，首先应当审查该合同是否有效。若有效则进一步注意合伙人的出资是否符合法律规定以及关于合伙期限、入伙、退伙的约定等。需要注意的是，《合伙企业法》第32条规定，合伙企业的利润和亏损，由全体合伙人依照合伙协议约定的比例分配和分担。合伙协议未约定利润分配和亏损分担比例的，由各合伙人平均分配和分担。合伙协议不得约定将全部利润分配给部分合伙人或者由部分合伙人承担全部亏损。
法律依据《中华人民共和国合同法》第一百二十八条

多人股份合作协议书

合伙人姓名： 性别： 身份证号： (以下简称甲方)

合伙人姓名： 性别： 身份证号： (以下简称乙方)

合伙人本着公平、平定、互利的原则，在不违反法律法规的前提下，订立合伙协议如下：

第一条： 合作宗旨，合伙人以自愿为原则，用合伙人自身具备的优势和能力，创造一个行业，把合伙人自身的价值体现出来，通过合法的手段，创造劳动成果。

第二条：合伙经营项目

该合作企业位于：

主要经营范围为：

二、合作方式。

在合作期限内双方共同投资，共同经营，共负盈亏(如房租，水电，购买材料及施工工具)甲乙双方共同承担，各出百分之五十。每做一笔生意所赚金额除去开销后平分(备注：无论承接的工程大小，每向客户交完货之时，无论是否完全收款，双方都应立即做好亏盈账目，除去开支，应立即平分所赚金额，留有余款的工程，双方共同承担向客户收余款的权益与义务)甲乙双方权益与义务平等，乙方对工作的一切事宜，拥有发言权，和决断权(如材料购进，工程外包，工人聘请，包括与客户溢价，签单，收款等一切事宜)甲乙双方其权限是： ①对外开展业务，订立合同;②对合伙事业进行日常管理;③购进和出售产品;④支付合伙债务;⑤开支实行公开制度须甲乙双方签字认可，共同决定合伙重大事项

第三条：合伙期限 合伙期限为 年，自 年 月 日起，至 年 月 日止。

第四条：投资额、方式、 合伙人都以现金方式投资，具体投资金额，按实际所需待定。 合伙期间各合伙人的投资为共有财产，(如施工工具，办公用品，店铺装修等)不得随意请求分割，合伙终止后，各合伙人的投资仍为个人所有，投资款合伙人自行约定时间予以返还

第五条：入伙、退伙，投资的转让

1、 入伙：1需承认本合同;2需经全体合伙人同意;3执行合同规定的权利和义务。

2、 退伙：1需所有合伙人认同的正当理由方可退伙;2不得在合伙不利时退伙;3退伙需提前1个月告知其他合伙人并经全体合伙人同意;4退伙后以退伙时的财产状况进行结算;5未经合伙人同意而自行退伙给合伙造成损失的，应进行赔偿，投资初期的投资金充公，不予退还。

3、投资的转让：允许合伙人转让自己的投资。转让时合伙人有优先受让权，如让合伙人以外的第三人，须经所有合伙人同意，并且第三人按入伙对待，否则以退伙对待转让人。

第六条：纠纷的解决 合伙人之间如发生纠纷，应共同协商，本着有利于合伙事业发展的原则予以解决。如协商不成，可以诉诸法院。

第七条：禁止行为

1、禁止合伙人自己或以合伙人名义参与或实施违法犯罪活动，如经证实后，确有此事，将报告或扭送公安机关，由公安机关处置，责任由个人承担，与合伙和其他合伙人无关，造成损失由当事人按实际损失赔偿。

2、在进行业务活动期间，禁止合伙人之间的私人恩怨，如因私人恩怨造成损失者，由当事人按实际损失赔偿。

3、未经全体合伙人同意，禁止任何合伙人私自以合伙名义进行业务活动;如其业务获得利益归合伙，造成损失由当事人按实际损失赔偿。

4、禁止合伙人经营与合伙竞争的业务。

5、禁止合伙人再加入其他合伙。

6、如合伙人违反上述各条，应按合伙实际损失赔偿。劝阻不听者可由全体合伙人决定除名。

第八条：合伙的终止及终止后的事项

1、合伙因以下事由之一得终止：1合伙期届满;2全体合伙人同意终止合伙关系;3合伙事业完成或不能完成;4合伙事业违反法律被撤销;5法院根据有关当事人请求判决解散。

2、合伙终止后的事项：1即行邀请中间人和公证员清算并给与公正;2清算后如存盈余，则按收取债权、清偿债务、返还投资、按比例分配剩余财产的顺序进行。固定资产和不可分物，可作价卖给合伙人或第三人，其价款参与分配;3清算后如有亏损，不论合伙人投资多少，先以合伙共同财产偿还，合伙财产不足清偿的部分，由合伙人按投资比例承担。

第九条：本合同如有未尽事宜，应由合伙人集体讨论补充或修改，补充和修改的内容与本合同共同有同等效力，具体事宜详见附件内容。

第十条：本合同正本一式2份，合伙人各执一份，本协议自合伙人签字(或盖章)之日起生效。

合伙人： (签字或盖章) 联系电话： 日期：

合伙人： (签字或盖章) 联系电话： 日期：
法律依据《中华人民共和国中外合资经营企业法》第十三条