如果工伤赔偿协议是在劳动仲裁委员会调解下达成的，可以凭身份证、仲裁调解书、生效证明，向法院申请强制执行。
如果是你与用人单位达成调解协议的，可以持调解协议书向人民法院申请支付令。
劳动争议调解仲裁法第十六条因支付拖欠劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金事项达成调解协议，用人单位在协议约定期限内不履行的，劳动者可以持调解协议书依法向人民法院申请支付令。人民法院应当依法发出支付令。
劳动争议发生后，当事人可以协商解决，这是节约成本、最直接、最快捷的方法。双方达成赔偿协议，说明双方已无争议，债权债务关系已经确定，只待履行即告消灭。一方不履行协议，另一方可以依据该赔偿协议向法院提起诉讼。因工伤赔偿事项已转变为债权债务关系，可以不经过劳争议仲裁程序，自然不受申请仲裁期限的限制。
《中华人民共和国劳动争议处理条例》第六条规定：“劳动争议发生后，当事人应当协商解决;不愿协商或者协商不成的，可以向本企业劳动争议调解委员会申请调 解；调解不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院起诉。”
如果双方没有达成协议，那么双方的争议受仲裁时效约束。但是双方已经达成协议了，就不再受仲裁时效的约束了。双方达成了协议，如果对方不履行协议，就相当于违约，可以起诉到法院，这时候的纠纷不是在仲裁委员会的受理范围内了。
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