根据刑法第133条的规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，应当立案追究。
根据最高人民法院2000年11月10日公告、11月21日起施行的《关于审理交通肇事刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第2条第1款规定，交通肇事具有下列情形之一的，处3年以下有期徒刑或者拘役：
(1)死亡1人或者重伤3人以上，负事故全部或者主要责任的;
(2)死亡3人以上，负事故同等责任的;
(3)造成公共财产或者他人财产直接损失，负事故全部或者主要责任，无能力赔偿数额在30万元以上的。
第2条第2款规定，交通肇事致1人以上重伤，负事故全部或者主要责任，并具有下列情形之一的，以交通肇事罪定罪处罚：
(1)酒后、吸食毒品后驾驶机动车辆的;
(2)无驾驶资格驾驶机动车辆的;
(3)明知是安全装置不全或者安全机件失灵的机动车辆而驾驶的;
(4)明知是无牌证或者已报废的机动车辆而驾驶的;
(5)严重超载驾驶的;
(6)为逃避法律追究逃离事故现场的。
符合上述情形之一的，公安机关应当立案追究。应当注意，对于交通肇事案件是否决定立案，一是要分清事故责任，二是要看是否符合上述司法解释的具体标准。如果行为人只有违章行为，并未造成严重后果的，则不以犯罪论处，不予立案。
1、犯交通肇事罪的，处3年以下有期徒刑或者拘役;
2、交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处3年以上7年以下有期徒刑;
3、逃逸致人死亡的，处7年以上有期徒刑。
第一个区别是两者概念不同。交通肇事罪的内容在于违反交通法规而造成的事故，导致人员伤亡或财产损失，而危害公共安全罪是指犯罪分子利用各种不同的危险方法，例如纵火、投毒、爆炸等等恶劣手段，危害公共安全的行为。
第二个区别是两者犯罪构成不同。交通肇事罪影响的是交通运输方面的安全，一般表现驾驶人员的明知故犯或者因为盲目自信所造成的过失，例如超速、超车、酒驾、醉驾、逆行等等。这种情况往往是因为驾驶人存在不被发现就没事的心态造成的，明明知道这样做是违反了道路安全法规，但以为自己能够避免意外的发生，但最后造成严重的后果。
危害共安全罪影响的是社会的公共安全，即危害部分人员的人身和财产安全，犯罪情节比交通肇事罪严重，影响也比较大。例如犯罪行为人以私设电网、驾车撞人、向人群开枪等危险方法对社会造成危害的行为都属于危害公共安全罪。
第三个区别是两者犯罪后果不同。交通肇事罪在以下情况附上事故相应的责任：造成1人死亡或者3人以上重伤的，负事故的全部或者主要责任;造成3人或以上死亡的，负事故同等责任;造成公共财产或他人财物损失的，负事故全部或者主要责任。
如果是造成1人以上重伤的，并且有这些行为酒后、吸毒后驾驶，无证驾驶，明知车辆安全装置不安全而驾驶的，报废车辆、无牌车辆驾驶，严重超载，发生事故后逃离现场的也一律构成交通肇事罪。而危害公共安全罪是不一犯罪后果来定罪的，只要行为人有用危害到公共安全的方法而造成伤害的就构成这条罪行。
第四个区别是两者处罚不同。交通肇事罪造成一般交通事故的，是会处以3年以下的有期徒刑或者拘役，如果是肇事逃逸的或者有其他恶劣情节的，会处徒刑3-7年，如果是因逃逸造成他人死亡的，就会处以7年以上有期徒刑。而危害公共安全，但未造成严重危害的，会被处徒刑3-10年，使人重伤或者死亡的就要处以10年以上的有期徒刑、或者无期徒刑，甚至被判处死刑。
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