推行“三证合一”后，纳税人办理涉税事项有三项新变化。
一是新设立企业、农民专业合作社不再进行税务登记，不再领取税务登记证。
二是在企业办理有关涉税事宜时，采集补齐必要涉税基础信息。信息发生变化的，由企业直接向税务机关申报变更。
三是企业办理注销登记，须先向税务主管机关申报清税。由受理税务机关根据国税、地税清税结果向纳税人统一出具。企业持税务机关出具的，向企业登记机关申请办理注销登记。
新变化给税务机关带来了三方面的考验。
考验一，纳税服务和税源监控的关口需前移。企业领取营业执照之后，如果无法及时获取纳税事项告知，疏于办理后续的税种核定、申报方式确认、增值税一般纳税人登记和纳税申报等事项，那么，增值税抵扣权、开票权、减免税优惠和纳税信用等将受到影响，不利于纳税人开展正常经营业务，易产生纳税信用污点，同时不利于税务机关开展后续监管。
考验二，难以确保后续纳税服务信息的送达。工商登记不再事先核实信息的真实性，如果现场登记环节未告知企业相关纳税注意事项，将对上门核实、催报催缴和税务检查等带来不利影响。
考验三，由于缺失税务登记和纳税告知环节，不能对“虚假申报”直接认定偷税。税务机关必须增加一道“税务机关书面通知申报”程序，并将企业签名盖章的送达回证存档，才能保证认定偷税执法程序完备。
