1、申报：申请单位提出书面申请，填写《卫生许可证申请书》或者《卫生许可证变更申请书》，并递交符合卫生要求的有关材料。
2、登记：依照卫生许可受理规定和公共场所许可的条件，有关部门对属于受理范围的申报材料进行核对、登记。如果是公共场所，申请单位要先办理建设项目卫生审查认定，等验收通过后，在申报办理《公共场所卫生许可证》。
3、受理：经过审查后，卫生行政部门在5个工作日内对符合受理规定的单位发放《行政许可受理通知书》;对不符合受理规定的发放《行政许可不予受理决定书》;对于资料不全的，发出《行政许可补正材料通知书》。
4、审查：卫生行政部门受理后，组织业务人员按照国家标准对申报材料进行审查，对于有问题的提出整改措施。
5、决定：自受理申请之日起二十日内，卫生行政部门根据审查意见，对符合规定的单位准予行政许可。
6、送达：卫生行政部门要在十个工作日内向作出准予行政许可决定的单位或者个人办法《卫生许可证》。
当然，在办理卫生许可证的过程中，卫生行政部门有权根据需求要求申请单位补充其他相关资料。
办理卫生许可证一般不超过2个月。
申请食品卫生许可证的单位和个人在办证窗口领取并填写《食品卫生许可证申请书》，同时提供以下资料：
1、 食品卫生许可证申请书;
2、 法定代表人、业主或负责人资格证明;
3 、生产经营场地平面图;
4 、食品从业人员健康检查和培训合格证明;
5 、新建、改建、扩建工程的预防性卫生审核材料;
6 、法律、法规、规章规定的或卫生行政部门要求提供的其他资料。
法律依据：
《行政许可法》第四十二条：除可以当场作出行政许可决定的外，行政机关应当自受理行政许可申请之日起二十日内作出行政许可决定。二十日内不能作出决定的，经本行政机关负责人批准，可以延长十日，并应当将延长期限的理由告知申请人。但是，法律、法规另有规定的，依照其规定。 依照本法第二十六条的规定，行政许可采取统一办理或者联合办理、集中办理的，办理的时间不得超过四十五日;四十五日内不能办结的，经本级人民政府负责人批准，可以延长十五日，并应当将延长期限的理由告知申请人。
闽公网安备 35020302001683号