把基本农田变为建设用地如果是经过国务院批准的就是属于合法变更，未经国务院批准的就属于违法变更。
《中华人民共和国土地管理法》第四十五条征收下列土地的，由国务院批准：
(一)基本农田;
(二)基本农田以外的耕地超过三十五公顷的;
(三)其他土地超过七十公顷的。
征收前款规定以外的土地的，由省、自治区、直辖市人民政府批准，并报国务院备案。 征收农用地的，应当依照本法第四十四条的规定先行办理农用地转用审批。
其中，经国务院批准农用地转用的，同时办理征地审批手续，不再另行办理征地审批;经省、自治区、直辖市人民政府在征地批准权限内批准农用地转用的，同时办理征地审批手续，不再另行办理征地审批，超过征地批准权限的，应当依照本条第一款的规定另行办理征地审批。
将农用地转为建设用地首先应向国土资源局、建设部门、规划部门提交用地申请，审查符合的颁发选址意见书，用地单位应按规定缴纳选址规费;然后核发建设项目用地预审报告书，办理立项、规划、环保许可等手续，并缴纳各项审批费用;最后向原预审的国土资源局提出项目用地的正式申请，经各级人民政府审批。
《土地管理法》第四十四条：
建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。永久基本农田转为建设用地的，由国务院批准。在土地利用总体规划确定的城市和村庄、集镇建设用地规模范围内，为实施该规划而将永久基本农田以外的农用地转为建设用地的，按土地利用年度计划分批次按照国务院规定由原批准土地利用总体规划的机关或者其授权的机关批准。
在土地利用总体规划确定的城市和村庄、集镇建设用地规模范围外，将永久基本农田以外的农用地转为建设用地的，由国务院或者国务院授权的省、自治区、直辖市人民政府批准。
(一)、农用地转用、征用土地，必须符合土地利用总体规划、城市建设总体规划和土地利用年度计划。
规划必须符合原国家局发布的《土地利用总体规划编制审批规定》的要求。
(二)、确认该农用地可以用于建设，再根据建设部门的要求，进行和编制建设项目可行性论证，向建设部门提交用地申请，建设部门审查符合的，颁发建设项目的《选址意见书》。用地单位应按规定缴纳选址规费。
(三)、用地单位持该《选址意见书》向同级国土资源局提出用地预审申请，由该国土资源局核发《建设项目用地预审报告书》。
建设项目用地预审文件有效期为两年，自批准之日起计算。
(四)、用地单位凭《建设项目用地预审报告书》向建设部门、环保局等办理立项、规划、环保许可等手续，并缴纳各项审批费用;
(五)、用地单位再持以上审批文件，向原预审的国土资源局提出项目用地的正式申请。
(六)、国土资源局根据土地利用总体规划、城市建设总体规划和土地利用年度计划，拟定农用地转用方案、补充耕地方案、征地方案和供地方案，分不同类型，经各级人民政府审批。
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