卫生事业预算内基建设资项目主要包括：公立非营利性医疗机构、疾病控制及妇幼保健等事业机构、卫生监督执法机构的新建、改扩建工程和限额以上的大中型医疗设备购置。其建设资金由同级计划部门根据项目的功能、规模核定安排。
医疗卫生机构的基本建设必须符合区域卫生规划要求。政府举办医疗卫生机构的基本建设项目，按基本建设程序分阶段编报项目建议书、可行性研究报告、初步设计等文件，按分级管理要求，经计划部门综合平衡、审核批准后列入年度基本建设投资计划。其他公立非营利性医疗机构的基本建设项目，按规定程序审核批准后，建设资金可由国家根据实际情况给予适当补助。私立非营利和营利性医疗机构的基本建设项目，也要纳入国家基本建设程序管理。
有条件的医疗卫生机构可以通过银行贷款、国外政府贷款和单位自筹等多种形式筹措资金，用于医疗卫生机构的发展建设。
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