两方协议与三方协议两者的区别如下：
1.两者签订的时间不同：三方协议是毕业生在毕业之前所签订的协议;而两方协议智能灯毕业生毕业，到单位报道时才可签订。
2.两者的签订主体不同：两方协议的主体只有毕业生与用人单位;而三方协议的主体是学校、毕业生与用人单位。
3.两者的目的不同：三方协议签订的目的是制定毕业生毕业后的一个就业方向，也是未来毕业生与用人单位签订劳动合同的依据;而两方协议的签订目的则是保护合同双方的基本权益。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第十条
【订立书面劳动合同】建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
两份协议与三方协议这两者的内容不同，我们可以根据这一点对这两者进行区分。两方协议也就是劳动合同，在劳动合同中必须明确规定合同的期限，约定双方权利与义务关系的内容条款，劳动报酬等内容;而三方协议中主要有毕业生自身情况，用人单位愿意接收等内容。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第十条
【订立书面劳动合同】建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
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